« Je note que son fils ainé qui aurait dû lui succéder est mort avant lui, ce qui semble aller avec le texte biblique qui dit que : tout premier-né mourra depuis le premier-né du pharaon qui doit s’asseoir sur son trône (EX 11,5). Mais il est possible que l’exode ait eu lieu entre les deux pendant une co-gérance. »
C’est également le cas d’Amenhotep Ier qui a accèdé au trône (très jeune) parce que son frère aîné est mort avant son père Ahmosé. Ahmenhotep I est le premier pharaon à avoir séparé sa sépulture de son temple funéraire. Il a peut-être pris cette mesure après avoir vu les pillages commis par les Hébreux. Quand ces derniers ont exhumé les restes de Joseph, ils ont probablement aussi mis à sac une bonne partie des tombeaux alentours. Les « quarante ans » passés dans le désert symboliseraient la durée du règne d’Amenhotep I. Les Hébreux ont attendu de voir dans quel sens « soufflait le vent » en Egypte pour avancer leurs pions en Canaan. Thoutmosis I succède à Amenhotep I alors qu’il n’est pas son fils. Amenhotep I n’a apparemment pas mené de campagne en Asie au contraire de Thoutmosis I qui lancera de grandes expéditions. Je pense qu’elles sont à mettre en parallèle avec les premières conquête de Josué.
En fait, il n’y a que sous Amenhotep IV que Canaan a été laissé à l’abandon. Comme le montre votre citation, les successeurs de Thoutmosis III y ont aussi eu une certaine activité même si elle a été moins importante que celle de leur prédecesseur.
La défaite que subissent les Shashou de YWH dans la lettre d’Amarna que vous citez doit correspondre dans le Livre des Juges à la défaite des Israelites face aux Madianites. (6-11) Les Madianites étant géographiquement plus proches de l’Egypte que les Israelites, ils devaient logiquement être encore plus fidèles au Pharaon sous peine de sanction immédiate. C’est donc l’armée madianite qui sous l’injonction pharaonique a dû vaincre les Hébreux. Ensuite les Hébreux ripostent avec Gédéon et bientôt Meggido se plaindra de l’alliance entre Sichem et les Hapirus. Et Gedeon habitait à Sichem.
Je ne crois pas qu’on puisse parler d’administration d’Amon pour Canaan. Les pharaons du Nouvel Empire promouvaient l’image syncrétique d’Amon-Ré ce qui montre déjà un certain retour à l’équilibre. Les gouverneurs cananéens obéissaient à l’administration pharaonique et c’est plutôt dans l’arrière cour de celle-ci qu’il faut chercher les dissensions. Canaan est très loin de Thèbes et si les peuples asiatiques avaient des liens privilégiés avec une capitale égyptienne, ce serait plutôt avec Héliopolis.
Le culte solaire d’Aton parait quand même bien éloigné de celui de YHW. Hypothèse : les prêtres d’Héliopolis ont d’abord voulu testé la nouvelle religion sur une petite partie de la population ( les Hyksos vaincus) avant de l’appliquer à l’ensemble de l’Egypte. Ils auraient renoncé devant la difficulté de la tâche et la main tendue par les Thèbains (Amon-Ré ). Akhenaton aurait ensuite maladroitement essayé d’en développer une version abâtardie.