@pemile
Peut-être qu’en stimulant le poisson rouge il pourrait y avoir un sursaut de réflexion ?
Pour évoquer les choses « simplement », pour ne pas trop heurter le poisson rouge, voici :
— Une phylogénie classe des séquences entre elles. Elle ne démontre pas leur origine biologique. Elle ne fait qu’ordonner un ensemble déjà « présumé viral ».
J’ai mis en « gras » pour être certain que vous puissiez bien voir.
Joseph Felsenstein, l’un des fondateurs modernes de l’inférence phylogénétique, écrit :“Phylogenetic methods reconstruct relationships among sequences or taxa ; they do not determine what those entities fundamentally are.”
... « Les méthodes phylogénétiques reconstruisent des relations, pas la nature ontologique des entités comparées. »
https://global.oup.com/academic/product/inferring-phylogenies-9780878931774?cc=ch&lang=en&
La phylogénie suppose l’existence préalable des objets comparés !
“Phylogenetic inference presupposes that the units being compared are real and comparable ; it does not establish their reality.”
https://academic.oup.com/sysbio/article-abstract/42/3/231/1629463